КПК

Показати повну версію : Геном


ALGS
14.03.2009, 23:20
По заказу.... Сорри ну это тезисно... очень сложно такие вещи расписать небиолагам от и до... Я понимаю может быть сложно или невсегда понятно - спрашивайте я попробую разобраться или обьяснить логику..
Весной 2000 года в канадском городе Ванкувере открылась престижная научная конференция. Сотни ученых из десятков стран собрались для того, чтобы подвести итоги работы по начатому 10 лет назад проекту расшифровки полной последовательности нуклеотидов генома человека. Конференция должна была сообщить миру сенсационную новость — усилия международного научного сообщества увенчались успехом и геном человека прочтен...
Проект «Геном человека» был начат в США в 1988 г. по инициативе лауреата Нобелевской премии Джеймса Уотсона, а в России — в 1989 г. по инициативе академика Александра Александровича Баева. Целью первого этапа проекта было определение полной последовательности нуклеотидов генома человека. Этот этап был завершен к концу 2000 года...

«Молекулярные часы» помогли определить дату разделения ветвей человека и обезьян — от 5 до 7 млн. лет назад. До этого палеонтологи полагали, что разделение произошло около 25 млн. лет назад. Однако теперь «молекулярная» датировка является общепринятой. Считается, что предки человека и шимпанзе разделились около 5 млн. лет назад, отделение горилл произошло раньше, и еще раньше, около 10—15 млн. лет назад, отделилась ветвь орангутангов...
Пока люди живут вместе, появляющиеся у них мутации распространяются по всей группе. Если же группы разделились, процесс накопления мутаций идет в них независимо. Многие из них (нейтральные) не отсеиваются отбором и, раз появившись, передаются из поколения в поколение. Мутации накапливаются в ДНК как песчинки в песочных часах. Чем дольше время после разделения групп или видов, тем больше различающих их мутаций накопится в их ДНК. Метод определения времени расхождения групп по числу различий в их ДНК назвали методом «молекулярных часов». Скорость хода «молекулярных часов» была установлена по скорости изменения ДНК тех видов, время расхождения которых было известно по ископаемым останкам...
Пока люди живут вместе, появляющиеся у них мутации распространяются по всей группе. Если же группы разделились, процесс накопления мутаций идет в них независимо. Многие из них (нейтральные) не отсеиваются отбором и, раз появившись, передаются из поколения в поколение. Мутации накапливаются в ДНК как песчинки в песочных часах. Чем дольше время после разделения групп или видов, тем больше различающих их мутаций накопится в их ДНК. Метод определения времени расхождения групп по числу различий в их ДНК назвали методом «молекулярных часов». Скорость хода «молекулярных часов» была установлена по скорости изменения ДНК тех видов, время расхождения которых было известно по ископаемым останкам.
Адам и Ева
Для сравнительного исследования генетического родства популяций используют и ядерную ДНК, и ДНК, содержащую¬ся в цитоплазме, в клеточных органеллах — митохондриях.
Митохондрии — «энергетические станции» клетки — содержат кольцевую молекулу ДНК. Митохондриальная ДНК (мтДНК) человека состоит из 16500 пар нуклеотидов — это совсем немного по сравнению с ДНК хромосом, находящихся в ядре клетки и состоящих из десятков и сотен миллионов пар нуклеотидов. Кроме того, мтДНК передается только по материнской линии и не участвует в рекомбинации, что упрощает ее анализ. Так как мтДНК мутирует в 10 раз чаще, чем ядерная ДНК, это делает «часы» более точными
Получившие известность исследования, выявившие общ¬ность происхождения мтДНК ныне живущих людей, были проведены в 1987 г. Аланом Уилсоном и его коллегами из Калифорнийского университета в Беркли. Они изучили мтДНК представителей различных рас — африканцев, азиатов, европе¬оидов. Наибольший уровень разнообразия ДНК был найден в Восточной Африке, что указывает на африканское происхож¬дение человека современного типа. По числу накопившихся в ДНК разных людей мутаций Уилсон оценил время существования общей для них предковой последовательности
В соответствии с его выводами, общая «праматерь», к которой восходят все типы мтДНК современных людей, жила в Восточной Африке менее 200 000 лет назад. Обладательницу этой мтДНК тут же окрестили «митохондриальной Евой», что породило неверные толкования — будто все человечество произошло от одной женщины. На самом деле у «Евы» было несколько тысяч соплеменниц, просто их митохондриальные ДНК до наших времен не дошли. Однако они, без сомнения, внесли свой вклад — от них мы унаследовали генетический материал хромосом. Характер наследования в данном случае можно сравнить с семейным имуществом — деньги и земли человек может получить от всех предков, а фамилию — только от одного из них.
Генетическим аналогом фамилии, передаваемой по женской линии, является митохондриальная ДНК, а по мужской — Y-хромосома, передаваемая от отца к сыну.
Оценки времени существования общего предка по мужской линии, сделанные на основе изучения Y-хромосомы, показали, что «Адам» также жил в Африке и примерно в то же время, что и «Ева». Эволюционная история мтДНК и Y-хромосомы отличается, так как связана с разными брачными традициями, разным поведением мужчин и женщин при переселениях, завоеваниях или колонизации. На основе изучения линий Y-хромосомы и мтДНК составлена карта расселения людей с аф¬риканской прародины.

Исследования ДНК неандертальцев
Кроме отсутствия рекомбинации и передачи по материнской линии, мтДНК обладает особенностями, делающими ее удобным (а подчас, единственно возможным) объектом при молекулярно-генетическом исследовании ископаемых останков. В клетке присутствует 100-1000 копий мтДНК (по сравнению с единичными копиями ядерных генов). Кроме того, кольцевая форма мтДН К делает ее более устойчивой к разруше¬нию, которое часто начинается со свободных концов молекулы.
Сначала были изучены останки неандертальца из Фельдхо-феровской пещеры близ Дюссельдорфа в Германии. Найденные в 1856 г. рабочими массивная черепная крышка и часть необычного скелета поначалу были приняты учеными за останки гигантского гиббона. В 1863 г. английский антрополог и анатом Уильям Кинг предложил для находки название Homo nean-derthalensis. Предполагалось, что неандерталец мог быть предком современного человека.
В 1997 г. работавшему в Германии генетику Сванте Пэбо удалось прочесть участок мтДНК, выделенной из этих останков неандертальца- Летом 2000 года появилось сообщение другой группы ученых об исследовании второго образца неандертальской мтДНК, выделенной из останков скелета ребенка, найденного в пещере Мезмай на Северном Кавказе. Во втором случае останки точно датированы радиоуглеродным методом — им 29 000 лет. Это представитель одной из последних живших на Земле групп неандертальцев.
Неандертальцы представляют собой группу гоминид, кото¬рая населяла Европу и Западную Азию в период от 300 000 до 28 000 лет назад. Часть этого времени они сосуществовали с человеком современного анатомического типа, расселившимся в Европе около 40 000 лет назад. Ранее на основе морфологического сравнения неандертальцев с человеком современного типа было выдвинуто три гипотезы: 1) неандертальцы были прямым предком человека; 2) они внесли некоторый генетический вклад в генофонд Homo sapiens; 3) они были независимым ви¬дом и полностью были замещены человеком современного типа, не внося генетического вклада.
Обе неандертальских мтДНК имеют общие отличия от мтДНК людей. Отличия нуклеотидных последовательностей выходят за границы внутривидового разнообразия Homo sapiens. Это говорит о том, что неандертальцы представляют отдельный, хотя и близкородственный человеку, вид. Время существования последнего общего предка человека и неандертальца оценивается по числу различий между мтДНК как 500 тыс. лет. По палеонтологическим данным предки Homo neanderthalensis и Homo sapiens разошлись 300 тыс. лет назад, при этом предки людей остались в Африке, а предки неандертальца ушли в Европу.
Неандерталец эволюционировал в Европе одновременно с эволюцией современного человека в Африке. Судя по генетическим данным, эти процессы шли независимо, и неандерталец не внес генетический материал в генофонд человечества, во всяком случае, до сих пор такой вклад не обнаружен.
Известно, что 40—50 тысяч лет назад человек расселился по Европе, а 28 тысяч лет назад вымерли неандертальцы. Не известно, какова связь этих событий — проиграл ли неандерталец в конкуренции с человеком, или его вымирание связано с изменением климата. Пропорции тела неандертальцев показывают адаптацию к очень холодному климату.
Исследование разнообразия ядерных генов человека, в том числе повторяющихся последовательностей, и сравнение их с разнообразием генов шимпанзе и других животных показало, что человечество недавно (в эволюционных масштабах) прошло через «бутылочное горлышко» — резкое падение численности популяции.
Различные группы генетиков, исходя из оценок генетического разнообразия современных популяций человека, пришли к выводу, что на протяжении последнего миллиона лет численность одновременно живущих прямых предков человека коле¬балась от 40 до 100 тысяч. В период прохождения «бутылочного горлышка» (90-130 тыс. лет назад) она сократилась до 10 тысяч индивидов, то есть на 75-90%, что привело к утрате значительной части генетического разнообразия.
Сравнительное исследование мтДНК разных популяций современных людей позволило выдвинуть предположение, что еще до выхода из Африки, около 60-70 тыс. лет назад (в этот период также наблюдалось снижение численности, но не столь значительное, как предыдущее) предковая популяция раздели¬лась по крайне мере на три группы, давшие затем начало трем расам — африканской (негроидной), азиатской (монголоид¬ной) и европейской (европеоидной).
Изучение генетического разнообразия популяций человека имеет большое значение не только для понимания процесса антропогенеза, но и для понимания механизмов адаптации попу¬ляций к различным условиям обитания, устойчивости или восприимчивости к тем или иным заболеваниям, для разработ¬ки методов ДНК-идентификации личности и для ДНК-диагно¬стики наследственных и онкологических заболеваний.
(с) Геном, клонирование, происхождение человека Под общей редакцией члена-корреспондента РАН Л. И. Корочкина, 2004
http://rapidshare.com/files/209240671/Gen.rar.html тут главы которые могут вам быть интересны.. дабы не нагружать много текста... Если понравится - скачайте полностью книжку.. Одна из лучших как по мне, в плане доступным языком написана и носить "последнюю инфу"..

F.N.
15.03.2009, 01:52
Так розшифрували геном, чи ні?
ПС. Аватар просто клас.

lingvo
15.03.2009, 10:42
Alien

Розкажи більш детально про твою можливість розшифрувати послідовність нуклеотидів матричної ДНК. Що для цього необхідно і які результати можно отримати цим методом?

ALGS
15.03.2009, 16:11
Так розшифрували геном, чи ні?
ПС. Аватар просто клас.
саму последовательность да расшифровали еще 2000 году где-то.. правда там есть еще малая погрешность, но это незначительно особо..
а вот что обозначает каждый ген и его функцию пока нет, далеко не все... У нас около 30 тыщ генов..
геном из всей ДНК оставляет 3%, остальное сателлитный мусор, то есть его составляют в большей степени побитые вирусы (попали в организм уже поврежденными или потом из-за каких-то факторов стали неработоспособными и встряли в геном или общую ДНК).. В последовательностях цепочи есть определенные триплеты (3 подрят основания) которые говорят что это начало гена и есть триплеты терменирующие, конец гена... Так вот иногда может проиходить сдвиг этих триплетов в сторону мусора из-за чего развиватся рак или други ген болезни...

Сварг - так вод подошел к ответу... ну чтоб в 2х словах... мДНК, в ней плюс в том что она почти не участвует в рекомбинации... имеется ввиду та матричная которая еще находится в митохондриях (органелла, отвечающая за дыхание).. То есть ДНК в клетке находится не тока в ядре, но и в некоторых органеллах (в митохондрии она от матери передается)... Так вот засчет того что она там "не спаривалась часто" и редко мутировала (изменялась) очень малая погрешность в том, чтоб узнать о генетическом древе твоего рода...
К примеру в криминалистике каким образом делает экспертизы, чтоб узнать кто приступник..? методом ПЦР проверяют сходство не генома (потому что он одинаков на 99.9% даже с негром или китайцем, очень сложно), а вот как раз с сателлитами (наличием битых вирусных участков или нефункциональных последовательностей, в определенных местах цепочки).. Ну к примеру твой родственник болел чем-то в 345году или 10 тыщ лет назад, это все отобразится в этих сателлитах (как песочные часы со временем)...
Если ты откроешь мой док в приложении, так такой методикой определили не только происхождение человека, но и даты его происхождения, а так же года переселения, там есть схемка.. Эти даты отличаются от археологов в 5 раз и являются более точными.
Это не моя возможность, а в каждой стране есть лабы такие... Ну как по мне стоит чуть подождать, лет 10.. дождаться полной расшифровки самого генома (ихней функции)..
Для справки:
Обчная ДНК это двухцепочная, мДНК - одноцепочная образуется с ДНК (функция мДНК - учавствует в создние белков\ферментов), если ДНК с мусором в длине составляет 4см (если развернуть в длину, 8е чудо света)!!!! :) то мДНК оно короткая, в ней находятся уже только гены и то определенного характера, в зависимости в каком органе или участка тела находятся.
Есть еще РНК, разница от ДНК лишь в одном атоме.. (-ОН или -Н группе и все), РНК может быть тоже двухцепочной как и ДНК наоборот... Это чтоб развеять стереотипы..

lingvo
15.03.2009, 22:28
готов сдать мне кровь, я сделаю сиквенс матричной ДНК, проверим какой ты у нас "арий белокровный"?!)))))
Шкода, з цих слів я зрозумів, що у тебе є можливість це зробити. Але нажаль, ні.

ALGS
15.03.2009, 22:42
1- есть, но не общедоступно...
2- для более корректных результатов стоит подождать еще лет 10.. дабы проверить изьяны методики...
3- я уверен, что результаты для многих из вас будут неутешными... для тех кто называет себя чистокровными ариями)))
Я к тому, что при высказывании такого рода реплик как у Блондина, стоит иметь здравый смысл..

Velzevul
16.03.2009, 00:18
А когда узнают от кого произошли те обезьяны от которых произошли мы? =)

ALGS
16.03.2009, 00:28
негры? а ты не понял шо они просто не прошли все ступени развития...))
когда были переселения ты вспомни, часть умных ушла, а часть тупых осталась в Африке по сей день.. вот те которые умные ушли развились, потому что они изначально были храбры и терзало чувство интереса...
Те которые остались дали свое поколение, тех которых ниче не интересует и сегодня, кроме как бегать голышом по саванам))

Velzevul
16.03.2009, 00:33
негры? а ты не понял шо они просто не прошли все ступени развития...))
когда были переселения ты вспомни, часть умных ушла, а часть тупых осталась в Африке по сей день.. вот те которые умные ушли развились, потому что они изначально были храбры и терзало чувство интереса...
Те которые остались дали свое поколение, тех которых ниче не интересует и сегодня, кроме как бегать голышом по саванам))

Ну мне честно говоря трудно поверить, что мы от негров произошли. Не потому, что я презираю их и ненавижу. А потому, что это не кажется реалистичным. Напомни о каких годах идет речь, сколько тыс. лет?
Просто цивилизации зародились как раз не далеко от Африки - это раз.
Во вторых - индейцы и австралийские аборигены...ну негр туда дойти не мог...тут споры идут о том, смогли ли викинги туда дойти, не говоря уже о дикарях.

З.Ы. А ну типа 40-50 тыс. лет...ну бредятина.

ALGS
16.03.2009, 00:46
200 тыщ лет дета...
1- все архиологические даты с 2000 года недействительны (древние). Тут у меня даже сомнений не вызывало никогда.. У них слишком грубые подходы были к измерению..
2- остановимся на том что проихождение человека еще под вопросом. я сам допускаю еще инопланетные силы))
3- данная методика определения это преворот в науке.. Является самой точной на сегодняшний день.. Цель топика не 2й пункт, а скорее ознакомить с методикой, на чем базируется.. для ликбеза.
4- скачай тот материал..там вроде говорилось, что когда переселения были - был один континент, перейти на нынешние не составило друда...

Velzevul
16.03.2009, 01:09
Один континент был миллиарды лет назад. Тогда жизни не было ещё..

ALGS
16.03.2009, 01:17
не может быть... приведи источник не за один же день их стало настолько много чтоб были недоступны...

Velzevul
16.03.2009, 01:44
Скорость сближения материков приблизительно 2см в год. Не трудно посчитать, сколько понадобилось времени, что бы отплыть на тысячи километов.

F.N.
16.03.2009, 02:28
3- я уверен, что результаты для многих из вас будут неутешными... для тех кто называет себя чистокровными ариями)))
У тебе є гени аріїв для порівняння з нашими генами?

ALGS
16.03.2009, 16:25
по идее должны быть общедоступны... главное код (название) найти
а ресурсы тут (сиквенс и структура) -
http://ndbserver.rutgers.edu/
http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
http://www.molmovdb.org/

нужно статьи археологические почитать..там обязательно делали генетический анализ... в котором должны были написать код и место хранения.. а на вышеописанных сайтах он ищется.. и потом можно сопоставить со своим... правда нужно учесть и точечные мутации, нада чтоб спец анализировал..
это при условии что ДНК нормально сохранилась.. и не была сильно битая...

Гонта
25.03.2009, 20:44
Ученые научились распознавать смешанные образцы ДНК

Группа ученых из судебно-медицинской службы Великобритании разработала методику под названием "DNA Boost", позволяющую определить ДНК, даже если образцы смешанные, то есть содержат ДНК нескольких людей одновременно, сообщает Daily Telegraph.

До сих пор ученым удавалось идентифицировать не более 10% из 10 тысяч смешанных образцов, ежегодно анализируемых в связи с расследованием преступлений. "Раньше было крайне сложно расшифровать эти образцы, а значит, их было невозможно искать по базе ДНК", рассказал доктор Марк Пирс из Судебно-медицинской службы.

Теперь же специалисты из СМС разработали программу, способную сравнивать ДНК из "смеси", создавая возможные варианты. Далее эти данные вводятся в базу данных, на данный момент содержащую сведения о 4 миллиона людей, и соотносить полученные данные с содержимым базы данных потенциальных подозреваемых. Новая технология позволит вновь поднять тысячи "замороженных" дел, которые не удавалось раскрыть из-за невозможности проанализировать данные. Метод был опробован в четырех полицейских участках. Точность сравнения оказалась 100%.
podrobnosti.ua/technologies/2009/03/25/591367.html